公司办加油卡可以开具增值税专用发票，但需要满足一定的条件和遵循特定的流程。首先，公司必须是一般纳税人，并且具备开具增值税专用发票的资格。此外，税务备案的经营范围中必须包含加油服务。
在办理加油卡时，通常只能获得不征税的增值税普通发票。然而，当使用加油卡内的金额加油后，可以通过提交相关资料来申请增值税专用发票。具体来说，需要准备预存记录单、开票信息等文件，并将这些资料提交给加油站。加油站会将这些资料汇总到当地分公司，通常在两周左右可以开具出增值税专用发票。
具体申请流程如下：如果公司是一般纳税人，选择在中国石油加油站办理加油卡时，需要先将资金转入加油站指定的对公账户。之后，将充值凭单或网上银行转账凭证盖章后，拿到办理加油卡的站点。工作人员会根据充值金额为加油卡充值，并打印预存记录单。同时，还可以申请开通副卡，并合理分配充值金额。
当加油卡内的金额全部使用完毕后，公司需要准备开具专用发票的相关资料。这包括加油站开具的预存记录单、公司开票信息、经办人员身份证复印件以及委托书等。加油站会将这些资料提交到当地的中国石油分公司，经过一系列审核流程，大约两周后会开具出增值税专用发票。
值得注意的是，政策明确规定了加油卡开具发票的规则。根据《成品油零售加油站增值税征收管理办法》，加油站以收取加油凭证（簿）、加油卡方式销售成品油，不得在售卖时向用户开具增值税专用发票。只有当用户凭卡或加油凭证实际加油后，加油站才会根据加油卡或加油凭证回笼记录，向购油单位开具增值税专用发票。
总之，公司办加油卡开具增值税专用发票虽然有一定的要求和流程，但只要按规定操作，在实际加油消费后，就能顺利取得增值税专用发票，从而合理进行税费抵扣，满足企业在税务管理方面的需求。