摩托车上高速收费与汽车收费存在一定的差异，但也有一些相似之处。收费标准方面，摩托车收费各地不一，有的地方按照一类客车七座及以下的标准，每公里收费约为0.4元，有的地方则按车次收费，每车次费用在5元至30元之间，甚至有些地方会根据排量等因素进行差异化收费。相比之下，汽车收费则主要依据车辆大小和类型来划分，收费标准相对统一。
在缴费方式上，摩托车和汽车都支持多种支付方式，如现金、ETC支付等。但需要注意的是，摩托车在部分高速公路行驶时，可能会受到特殊规定的影响，例如限制特定时段通行、对车道有严格要求，甚至禁止某些类型摩托车通行等。这些特殊规定在一定程度上也影响了摩托车的收费情况。
从地区差异角度来看，摩托车收费的地区差异更为明显。有些地方将摩托车收费标准与小型客车看齐，每公里收费在0.4元至0.6元之间；而在另一些地区，摩托车可能被归为2类客车，费率大致在每公里0.5元到1元之间。此外，像新疆等地，对摩托车上高速采取免费政策，而汽车在各地基本不存在这样大幅度的差异政策。
在收费依据上，汽车主要依据车辆的大小、座位数等常规因素来划分收费档次。摩托车除了这些常规考量外，部分地区还会结合排量等因素进行差异化收费。比如一些地区对于大排量摩托车可能会收取更高的费用，这种综合考量因素在汽车收费体系中相对少见。
总的来说，摩托车上高速收费与汽车收费在标准、依据和特殊规定上都有不同程度的区别。摩托车收费更具灵活性和多样性，因地区不同产生的变化更为复杂。无论是摩托车骑手还是汽车驾驶员，在上高速前都应该了解当地的收费政策，以便顺利出行。