在4S店和普通汽修店进行汽车改色，费用存在显著差异，4S店的费用通常更高。这主要是由于多方面因素导致的。首先，4S店因品牌效应和更可靠的质量保障，价格普遍偏高。从材质上看，4S店使用的贴膜品牌更注重质量，喷漆常用金属漆料，成本较高。从工艺方面来看，复杂工艺的人工成本也相对较高。
普通汽修店虽然价格更具吸引力，但质量把控可能参差不齐。例如，喷漆改色方面，普通汽车在4S店全车喷漆一般需要5000元左右，而豪车则需要10000元以上。4S店常用的金属漆料，如杜邦漆，成本在1200-1600元之间，一个面的补漆费用大约在300-500元。
如果普通汽修店采用同等漆料，价格或许能低一些，但漆料质量和工艺可能难以保证。因为4S店深入了解品牌车漆特性，设备和人员专业，能精准调色，喷漆工艺成熟；而小型汽修厂调色多依赖经验，易出现色差问题。
贴膜改色的价格跨度也较大，少则几百元，多则上万元。4S店在选择贴膜品牌上更注重质量，所以价格高于普通汽修店。国产改色膜一般在1000-3000元，4S店使用国产膜整体价格会比汽修店高出几百元到上千元；专业进口水溶性膜五千至万元以上，4S店采用进口膜差价可能更大。
不同地区的4S店和汽修店改色费用也有区别。例如，在大城市，4S店全车贴膜基础款可能接近4000元，而汽修店可能在2500元左右；在中小城市或欠发达地区，4S店全车贴膜基础款可能在2000元左右，汽修店则在1500元上下。
此外，车型不同也会影响改色费用。普通家用轿车贴膜面积较小，4S店和汽修店价格差距相对较小；而对于SUV、MPV等车型，贴膜面积较大，4S店价格可能比汽修店贵上千元。
总之，4S店和普通汽修店的汽车改色费用因多种因素而不同。在选择时，车主需综合考量自身需求、预算以及对质量和售后的期望，权衡两者的利弊，做出最适合自己的选择。